Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mrpl53Q9D1H8 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mrpl53Q9D1H8 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mrpl53Q9D1H8 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Mrpl53Q9D1H8 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mrpl53Q9D1H8 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mrpl53Q9D1H8 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mrpl53Q9D1H8 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mrpl53Q9D1H8 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl53Q9D1H8 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl53Q9D1H8 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl53Q9D1H8 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl53Q9D1H8 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl53Q9D1H8 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl53Q9D1H8 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl53Q9D1H8 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl53Q9D1H8 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl53Q9D1H8 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl53Q9D1H8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl53Q9D1H8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl53Q9D1H8 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl53Q9D1H8 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl53Q9D1H8 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl53Q9D1H8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl53Q9D1H8 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl53Q9D1H8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl53Q9D1H8 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl53Q9D1H8 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl53Q9D1H8 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl53Q9D1H8 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl53Q9D1H8 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl53Q9D1H8 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl53Q9D1H8 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl53Q9D1H8 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl53Q9D1H8 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl53Q9D1H8 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl53Q9D1H8 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl53Q9D1H8 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl53Q9D1H8 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl53Q9D1H8 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl53Q9D1H8 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl53Q9D1H8 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl53Q9D1H8 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl53Q9D1H8 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl53Q9D1H8 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl53Q9D1H8 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl53Q9D1H8 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl53Q9D1H8 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl53Q9D1H8 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl53Q9D1H8 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl53Q9D1H8 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl53Q9D1H8 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl53Q9D1H8 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl53Q9D1H8 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl53Q9D1H8 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl53Q9D1H8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl53Q9D1H8 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl53Q9D1H8 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl53Q9D1H8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl53Q9D1H8 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl53Q9D1H8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl53Q9D1H8 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl53Q9D1H8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl53Q9D1H8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl53Q9D1H8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl53Q9D1H8 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl53Q9D1H8 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl53Q9D1H8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl53Q9D1H8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl53Q9D1H8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl53Q9D1H8 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl53Q9D1H8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl53Q9D1H8 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl53Q9D1H8 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl53Q9D1H8 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl53Q9D1H8 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl53Q9D1H8 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl53Q9D1H8 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
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