Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms