Protein–RNA interactions for Protein: Q9D103

Ifitm1, Interferon-induced transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm1Q9D103 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Ifitm1Q9D103 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ifitm1Q9D103 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Ifitm1Q9D103 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Ifitm1Q9D103 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Ifitm1Q9D103 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Ifitm1Q9D103 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Ifitm1Q9D103 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Ifitm1Q9D103 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ifitm1Q9D103 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ifitm1Q9D103 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ifitm1Q9D103 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ifitm1Q9D103 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ifitm1Q9D103 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ifitm1Q9D103 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ifitm1Q9D103 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ifitm1Q9D103 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ifitm1Q9D103 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ifitm1Q9D103 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ifitm1Q9D103 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Ifitm1Q9D103 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ifitm1Q9D103 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
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Ifitm1Q9D103 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
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Ifitm1Q9D103 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms