Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms