Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B8

Ribc1, RIB43A-like with coiled-coils protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc1Q9D0B8 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ribc1Q9D0B8 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ribc1Q9D0B8 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ribc1Q9D0B8 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ribc1Q9D0B8 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ribc1Q9D0B8 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ribc1Q9D0B8 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ribc1Q9D0B8 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ribc1Q9D0B8 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ribc1Q9D0B8 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ribc1Q9D0B8 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ribc1Q9D0B8 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ribc1Q9D0B8 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ribc1Q9D0B8 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ribc1Q9D0B8 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ribc1Q9D0B8 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ribc1Q9D0B8 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ribc1Q9D0B8 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ribc1Q9D0B8 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ribc1Q9D0B8 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ribc1Q9D0B8 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ribc1Q9D0B8 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ribc1Q9D0B8 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ribc1Q9D0B8 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ribc1Q9D0B8 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ribc1Q9D0B8 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ribc1Q9D0B8 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ribc1Q9D0B8 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ribc1Q9D0B8 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ribc1Q9D0B8 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ribc1Q9D0B8 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ribc1Q9D0B8 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ribc1Q9D0B8 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ribc1Q9D0B8 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ribc1Q9D0B8 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ribc1Q9D0B8 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ribc1Q9D0B8 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ribc1Q9D0B8 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ribc1Q9D0B8 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ribc1Q9D0B8 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ribc1Q9D0B8 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ribc1Q9D0B8 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ribc1Q9D0B8 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ribc1Q9D0B8 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ribc1Q9D0B8 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ribc1Q9D0B8 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ribc1Q9D0B8 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ribc1Q9D0B8 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ribc1Q9D0B8 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ribc1Q9D0B8 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ribc1Q9D0B8 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ribc1Q9D0B8 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ribc1Q9D0B8 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ribc1Q9D0B8 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ribc1Q9D0B8 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ribc1Q9D0B8 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ribc1Q9D0B8 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ribc1Q9D0B8 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ribc1Q9D0B8 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ribc1Q9D0B8 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ribc1Q9D0B8 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ribc1Q9D0B8 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ribc1Q9D0B8 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ribc1Q9D0B8 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ribc1Q9D0B8 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ribc1Q9D0B8 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ribc1Q9D0B8 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ribc1Q9D0B8 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ribc1Q9D0B8 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ribc1Q9D0B8 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ribc1Q9D0B8 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ribc1Q9D0B8 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ribc1Q9D0B8 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ribc1Q9D0B8 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ribc1Q9D0B8 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ribc1Q9D0B8 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ribc1Q9D0B8 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ribc1Q9D0B8 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ribc1Q9D0B8 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ribc1Q9D0B8 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ribc1Q9D0B8 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ribc1Q9D0B8 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ribc1Q9D0B8 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ribc1Q9D0B8 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ribc1Q9D0B8 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ribc1Q9D0B8 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ribc1Q9D0B8 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ribc1Q9D0B8 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ribc1Q9D0B8 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ribc1Q9D0B8 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ribc1Q9D0B8 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ribc1Q9D0B8 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ribc1Q9D0B8 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ribc1Q9D0B8 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ribc1Q9D0B8 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ribc1Q9D0B8 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ribc1Q9D0B8 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ribc1Q9D0B8 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ribc1Q9D0B8 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ribc1Q9D0B8 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms