Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mms19Q9D071 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms