Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYW4

Hdhd3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd3Q9CYW4 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hdhd3Q9CYW4 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hdhd3Q9CYW4 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hdhd3Q9CYW4 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hdhd3Q9CYW4 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hdhd3Q9CYW4 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hdhd3Q9CYW4 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hdhd3Q9CYW4 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hdhd3Q9CYW4 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hdhd3Q9CYW4 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hdhd3Q9CYW4 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hdhd3Q9CYW4 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hdhd3Q9CYW4 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hdhd3Q9CYW4 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hdhd3Q9CYW4 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hdhd3Q9CYW4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hdhd3Q9CYW4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hdhd3Q9CYW4 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hdhd3Q9CYW4 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hdhd3Q9CYW4 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hdhd3Q9CYW4 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hdhd3Q9CYW4 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hdhd3Q9CYW4 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hdhd3Q9CYW4 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hdhd3Q9CYW4 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hdhd3Q9CYW4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hdhd3Q9CYW4 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hdhd3Q9CYW4 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hdhd3Q9CYW4 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hdhd3Q9CYW4 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hdhd3Q9CYW4 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hdhd3Q9CYW4 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hdhd3Q9CYW4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hdhd3Q9CYW4 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hdhd3Q9CYW4 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hdhd3Q9CYW4 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hdhd3Q9CYW4 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hdhd3Q9CYW4 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hdhd3Q9CYW4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hdhd3Q9CYW4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hdhd3Q9CYW4 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hdhd3Q9CYW4 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hdhd3Q9CYW4 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hdhd3Q9CYW4 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hdhd3Q9CYW4 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hdhd3Q9CYW4 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hdhd3Q9CYW4 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hdhd3Q9CYW4 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hdhd3Q9CYW4 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hdhd3Q9CYW4 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hdhd3Q9CYW4 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hdhd3Q9CYW4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hdhd3Q9CYW4 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hdhd3Q9CYW4 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hdhd3Q9CYW4 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hdhd3Q9CYW4 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hdhd3Q9CYW4 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hdhd3Q9CYW4 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hdhd3Q9CYW4 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hdhd3Q9CYW4 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hdhd3Q9CYW4 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hdhd3Q9CYW4 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hdhd3Q9CYW4 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hdhd3Q9CYW4 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Hdhd3Q9CYW4 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Hdhd3Q9CYW4 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Hdhd3Q9CYW4 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Hdhd3Q9CYW4 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hdhd3Q9CYW4 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hdhd3Q9CYW4 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hdhd3Q9CYW4 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hdhd3Q9CYW4 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hdhd3Q9CYW4 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hdhd3Q9CYW4 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hdhd3Q9CYW4 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hdhd3Q9CYW4 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hdhd3Q9CYW4 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hdhd3Q9CYW4 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hdhd3Q9CYW4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hdhd3Q9CYW4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hdhd3Q9CYW4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hdhd3Q9CYW4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hdhd3Q9CYW4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hdhd3Q9CYW4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hdhd3Q9CYW4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hdhd3Q9CYW4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hdhd3Q9CYW4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hdhd3Q9CYW4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hdhd3Q9CYW4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hdhd3Q9CYW4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hdhd3Q9CYW4 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hdhd3Q9CYW4 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hdhd3Q9CYW4 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hdhd3Q9CYW4 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hdhd3Q9CYW4 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hdhd3Q9CYW4 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hdhd3Q9CYW4 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hdhd3Q9CYW4 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hdhd3Q9CYW4 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hdhd3Q9CYW4 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms