Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYB0

Trim13, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM13, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim13Q9CYB0 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim13Q9CYB0 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim13Q9CYB0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim13Q9CYB0 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim13Q9CYB0 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim13Q9CYB0 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim13Q9CYB0 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim13Q9CYB0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim13Q9CYB0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim13Q9CYB0 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim13Q9CYB0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim13Q9CYB0 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim13Q9CYB0 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim13Q9CYB0 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim13Q9CYB0 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim13Q9CYB0 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim13Q9CYB0 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim13Q9CYB0 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim13Q9CYB0 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim13Q9CYB0 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim13Q9CYB0 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim13Q9CYB0 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim13Q9CYB0 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim13Q9CYB0 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim13Q9CYB0 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim13Q9CYB0 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim13Q9CYB0 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim13Q9CYB0 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim13Q9CYB0 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim13Q9CYB0 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim13Q9CYB0 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim13Q9CYB0 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim13Q9CYB0 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim13Q9CYB0 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim13Q9CYB0 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim13Q9CYB0 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim13Q9CYB0 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim13Q9CYB0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim13Q9CYB0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim13Q9CYB0 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim13Q9CYB0 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim13Q9CYB0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim13Q9CYB0 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim13Q9CYB0 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim13Q9CYB0 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim13Q9CYB0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim13Q9CYB0 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim13Q9CYB0 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim13Q9CYB0 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim13Q9CYB0 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim13Q9CYB0 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim13Q9CYB0 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim13Q9CYB0 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim13Q9CYB0 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim13Q9CYB0 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim13Q9CYB0 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim13Q9CYB0 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim13Q9CYB0 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim13Q9CYB0 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim13Q9CYB0 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim13Q9CYB0 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim13Q9CYB0 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim13Q9CYB0 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Trim13Q9CYB0 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim13Q9CYB0 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim13Q9CYB0 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Trim13Q9CYB0 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim13Q9CYB0 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim13Q9CYB0 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim13Q9CYB0 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim13Q9CYB0 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim13Q9CYB0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim13Q9CYB0 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim13Q9CYB0 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim13Q9CYB0 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim13Q9CYB0 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim13Q9CYB0 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim13Q9CYB0 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim13Q9CYB0 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim13Q9CYB0 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim13Q9CYB0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim13Q9CYB0 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim13Q9CYB0 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim13Q9CYB0 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim13Q9CYB0 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim13Q9CYB0 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim13Q9CYB0 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim13Q9CYB0 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim13Q9CYB0 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim13Q9CYB0 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim13Q9CYB0 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim13Q9CYB0 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim13Q9CYB0 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim13Q9CYB0 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim13Q9CYB0 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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