Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl11Q9CXW4 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl11Q9CXW4 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl11Q9CXW4 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl11Q9CXW4 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl11Q9CXW4 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl11Q9CXW4 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl11Q9CXW4 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl11Q9CXW4 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl11Q9CXW4 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl11Q9CXW4 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl11Q9CXW4 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl11Q9CXW4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl11Q9CXW4 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl11Q9CXW4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl11Q9CXW4 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl11Q9CXW4 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl11Q9CXW4 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl11Q9CXW4 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl11Q9CXW4 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl11Q9CXW4 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl11Q9CXW4 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl11Q9CXW4 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl11Q9CXW4 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl11Q9CXW4 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl11Q9CXW4 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl11Q9CXW4 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl11Q9CXW4 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl11Q9CXW4 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl11Q9CXW4 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl11Q9CXW4 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl11Q9CXW4 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl11Q9CXW4 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl11Q9CXW4 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl11Q9CXW4 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl11Q9CXW4 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl11Q9CXW4 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl11Q9CXW4 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl11Q9CXW4 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl11Q9CXW4 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl11Q9CXW4 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl11Q9CXW4 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl11Q9CXW4 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl11Q9CXW4 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl11Q9CXW4 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl11Q9CXW4 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl11Q9CXW4 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl11Q9CXW4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl11Q9CXW4 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl11Q9CXW4 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl11Q9CXW4 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl11Q9CXW4 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl11Q9CXW4 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl11Q9CXW4 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl11Q9CXW4 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl11Q9CXW4 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl11Q9CXW4 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl11Q9CXW4 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl11Q9CXW4 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl11Q9CXW4 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms