Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX13

Cnih4, Protein cornichon homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih4Q9CX13 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms