Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUS9

Sppl3, Signal peptide peptidase-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl3Q9CUS9 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sppl3Q9CUS9 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms