Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS72

Filip1, Filamin-A-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Filip1Q9CS72 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Filip1Q9CS72 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms