Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR35

Ctrb1, Chymotrypsinogen B, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctrb1Q9CR35 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctrb1Q9CR35 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctrb1Q9CR35 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ctrb1Q9CR35 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ctrb1Q9CR35 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ctrb1Q9CR35 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctrb1Q9CR35 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Ctrb1Q9CR35 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
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Ctrb1Q9CR35 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ctrb1Q9CR35 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ctrb1Q9CR35 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctrb1Q9CR35 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctrb1Q9CR35 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctrb1Q9CR35 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctrb1Q9CR35 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctrb1Q9CR35 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctrb1Q9CR35 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctrb1Q9CR35 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctrb1Q9CR35 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctrb1Q9CR35 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ctrb1Q9CR35 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctrb1Q9CR35 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctrb1Q9CR35 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctrb1Q9CR35 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctrb1Q9CR35 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctrb1Q9CR35 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctrb1Q9CR35 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctrb1Q9CR35 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctrb1Q9CR35 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Ctrb1Q9CR35 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctrb1Q9CR35 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctrb1Q9CR35 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctrb1Q9CR35 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctrb1Q9CR35 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctrb1Q9CR35 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctrb1Q9CR35 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctrb1Q9CR35 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctrb1Q9CR35 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ctrb1Q9CR35 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ctrb1Q9CR35 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctrb1Q9CR35 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctrb1Q9CR35 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctrb1Q9CR35 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctrb1Q9CR35 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctrb1Q9CR35 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctrb1Q9CR35 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctrb1Q9CR35 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctrb1Q9CR35 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ctrb1Q9CR35 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctrb1Q9CR35 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ctrb1Q9CR35 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctrb1Q9CR35 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctrb1Q9CR35 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ctrb1Q9CR35 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Ctrb1Q9CR35 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctrb1Q9CR35 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctrb1Q9CR35 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctrb1Q9CR35 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctrb1Q9CR35 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctrb1Q9CR35 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctrb1Q9CR35 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctrb1Q9CR35 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctrb1Q9CR35 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctrb1Q9CR35 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctrb1Q9CR35 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctrb1Q9CR35 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctrb1Q9CR35 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctrb1Q9CR35 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms