Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufb9Q9CQJ8 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms