Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Atp6v0e1Q9CQD8 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Atp6v0e1Q9CQD8 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Atp6v0e1Q9CQD8 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Atp6v0e1Q9CQD8 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Atp6v0e1Q9CQD8 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Atp6v0e1Q9CQD8 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Atp6v0e1Q9CQD8 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Atp6v0e1Q9CQD8 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Atp6v0e1Q9CQD8 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Atp6v0e1Q9CQD8 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Atp6v0e1Q9CQD8 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
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