Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms