Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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