Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
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Commd4Q9CQ02 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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