Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

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Length 171 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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