Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL6

Ubxn6, UBX domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn6Q99PL6 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms