Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms