Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB1

Tlr3, Toll-like receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr3Q99MB1 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tlr3Q99MB1 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms