Protein–RNA interactions for Protein: Q99LB7

Sardh, Sarcosine dehydrogenase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SardhQ99LB7 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SardhQ99LB7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SardhQ99LB7 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SardhQ99LB7 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SardhQ99LB7 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SardhQ99LB7 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SardhQ99LB7 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SardhQ99LB7 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms