Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pagr1aQ99L02 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pagr1aQ99L02 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms