Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms