Protein–RNA interactions for Protein: Q99J95

Cdk9, Cyclin-dependent kinase 9, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk9Q99J95 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Cdk9Q99J95 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdk9Q99J95 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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