Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ddb2Q99J79 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ddb2Q99J79 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ddb2Q99J79 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ddb2Q99J79 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ddb2Q99J79 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Ddb2Q99J79 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ddb2Q99J79 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ddb2Q99J79 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ddb2Q99J79 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ddb2Q99J79 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ddb2Q99J79 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ddb2Q99J79 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ddb2Q99J79 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ddb2Q99J79 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ddb2Q99J79 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ddb2Q99J79 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ddb2Q99J79 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ddb2Q99J79 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ddb2Q99J79 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ddb2Q99J79 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Ddb2Q99J79 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Ddb2Q99J79 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ddb2Q99J79 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ddb2Q99J79 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Ddb2Q99J79 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Ddb2Q99J79 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ddb2Q99J79 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ddb2Q99J79 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Ddb2Q99J79 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Ddb2Q99J79 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ddb2Q99J79 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ddb2Q99J79 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ddb2Q99J79 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ddb2Q99J79 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ddb2Q99J79 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Ddb2Q99J79 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ddb2Q99J79 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ddb2Q99J79 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ddb2Q99J79 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ddb2Q99J79 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ddb2Q99J79 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ddb2Q99J79 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ddb2Q99J79 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ddb2Q99J79 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ddb2Q99J79 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ddb2Q99J79 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ddb2Q99J79 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ddb2Q99J79 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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