Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms