Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms