Protein–RNA interactions for Protein: Q924W5

Smc6, Structural maintenance of chromosomes protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc6Q924W5 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smc6Q924W5 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smc6Q924W5 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smc6Q924W5 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smc6Q924W5 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smc6Q924W5 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smc6Q924W5 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smc6Q924W5 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smc6Q924W5 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smc6Q924W5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smc6Q924W5 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Smc6Q924W5 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms