Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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