Protein–RNA interactions for Protein: Q922B6

Traf7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf7Q922B6 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf7Q922B6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms