Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Atl3Q91YH5 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atl3Q91YH5 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atl3Q91YH5 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atl3Q91YH5 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atl3Q91YH5 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atl3Q91YH5 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atl3Q91YH5 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Atl3Q91YH5 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atl3Q91YH5 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atl3Q91YH5 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atl3Q91YH5 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atl3Q91YH5 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atl3Q91YH5 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atl3Q91YH5 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Atl3Q91YH5 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atl3Q91YH5 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atl3Q91YH5 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atl3Q91YH5 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atl3Q91YH5 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atl3Q91YH5 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atl3Q91YH5 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atl3Q91YH5 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atl3Q91YH5 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atl3Q91YH5 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atl3Q91YH5 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atl3Q91YH5 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atl3Q91YH5 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atl3Q91YH5 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Atl3Q91YH5 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atl3Q91YH5 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atl3Q91YH5 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atl3Q91YH5 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atl3Q91YH5 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atl3Q91YH5 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atl3Q91YH5 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atl3Q91YH5 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atl3Q91YH5 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atl3Q91YH5 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atl3Q91YH5 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atl3Q91YH5 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atl3Q91YH5 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atl3Q91YH5 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atl3Q91YH5 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atl3Q91YH5 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Atl3Q91YH5 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atl3Q91YH5 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atl3Q91YH5 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atl3Q91YH5 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atl3Q91YH5 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atl3Q91YH5 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atl3Q91YH5 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Atl3Q91YH5 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atl3Q91YH5 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atl3Q91YH5 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atl3Q91YH5 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atl3Q91YH5 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atl3Q91YH5 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atl3Q91YH5 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atl3Q91YH5 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atl3Q91YH5 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atl3Q91YH5 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms