Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms