Protein–RNA interactions for Protein: Q91VH2

Snx9, Sorting nexin-9, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx9Q91VH2 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx9Q91VH2 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms