Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr362-201ENSMUST00000100144 954 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16112-201ENSMUST00000159075 382 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm36278-201ENSMUST00000217030 918 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 AC154595.1-201ENSMUST00000225533 1059 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Cd3e-201ENSMUST00000102832 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Il10-201ENSMUST00000016673 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr1171-ps1-202ENSMUST00000150178 1398 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Tm6sf1-202ENSMUST00000119543 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12001-201ENSMUST00000121727 913 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 AC153512.2-201ENSMUST00000220363 1273 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr851-201ENSMUST00000064582 939 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp865-202ENSMUST00000076791 1129 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms