Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms