Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cul7Q8VE73 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cul7Q8VE73 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cul7Q8VE73 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cul7Q8VE73 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cul7Q8VE73 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cul7Q8VE73 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cul7Q8VE73 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cul7Q8VE73 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cul7Q8VE73 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cul7Q8VE73 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cul7Q8VE73 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cul7Q8VE73 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cul7Q8VE73 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cul7Q8VE73 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cul7Q8VE73 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cul7Q8VE73 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cul7Q8VE73 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cul7Q8VE73 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cul7Q8VE73 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cul7Q8VE73 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cul7Q8VE73 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cul7Q8VE73 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cul7Q8VE73 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cul7Q8VE73 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cul7Q8VE73 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cul7Q8VE73 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cul7Q8VE73 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cul7Q8VE73 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cul7Q8VE73 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cul7Q8VE73 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cul7Q8VE73 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cul7Q8VE73 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cul7Q8VE73 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cul7Q8VE73 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cul7Q8VE73 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cul7Q8VE73 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cul7Q8VE73 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cul7Q8VE73 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cul7Q8VE73 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cul7Q8VE73 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cul7Q8VE73 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cul7Q8VE73 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cul7Q8VE73 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cul7Q8VE73 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cul7Q8VE73 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cul7Q8VE73 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cul7Q8VE73 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cul7Q8VE73 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cul7Q8VE73 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cul7Q8VE73 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cul7Q8VE73 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cul7Q8VE73 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cul7Q8VE73 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cul7Q8VE73 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cul7Q8VE73 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cul7Q8VE73 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cul7Q8VE73 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cul7Q8VE73 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cul7Q8VE73 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cul7Q8VE73 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cul7Q8VE73 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cul7Q8VE73 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cul7Q8VE73 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cul7Q8VE73 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cul7Q8VE73 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cul7Q8VE73 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cul7Q8VE73 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cul7Q8VE73 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cul7Q8VE73 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cul7Q8VE73 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cul7Q8VE73 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cul7Q8VE73 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cul7Q8VE73 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cul7Q8VE73 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cul7Q8VE73 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms