Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU3

Apol9a, Apol9a protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol9aQ8VDU3 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apol9aQ8VDU3 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms