Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fyco1Q8VDC1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fyco1Q8VDC1 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms