Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC34

Rpap2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase Rpap2, mousemouse

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Length 614 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rpap2Q8VC34 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Rpap2Q8VC34 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Rpap2Q8VC34 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Rpap2Q8VC34 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rpap2Q8VC34 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Rpap2Q8VC34 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpap2Q8VC34 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpap2Q8VC34 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpap2Q8VC34 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpap2Q8VC34 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpap2Q8VC34 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpap2Q8VC34 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpap2Q8VC34 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpap2Q8VC34 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpap2Q8VC34 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpap2Q8VC34 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpap2Q8VC34 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpap2Q8VC34 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rpap2Q8VC34 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms