Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4R6

Nup35, Nucleoporin NUP53, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup35Q8R4R6 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nup35Q8R4R6 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms