Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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