Protein–RNA interactions for Protein: Q8R332

Nup58, Nucleoporin p58/p45, mousemouse

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Length 587 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Nup58Q8R332 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Nup58Q8R332 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup58Q8R332 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Nup58Q8R332 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Nup58Q8R332 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup58Q8R332 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Nup58Q8R332 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Nup58Q8R332 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Nup58Q8R332 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup58Q8R332 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
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Nup58Q8R332 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms