Protein–RNA interactions for Protein: Q8K352

Sash3, SAM and SH3 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sash3Q8K352 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sash3Q8K352 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms