Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrrdQ8K2M3 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrrdQ8K2M3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrrdQ8K2M3 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrrdQ8K2M3 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrrdQ8K2M3 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SrrdQ8K2M3 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrrdQ8K2M3 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrrdQ8K2M3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrrdQ8K2M3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrrdQ8K2M3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrrdQ8K2M3 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrrdQ8K2M3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrrdQ8K2M3 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrrdQ8K2M3 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrrdQ8K2M3 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SrrdQ8K2M3 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrrdQ8K2M3 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrrdQ8K2M3 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SrrdQ8K2M3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SrrdQ8K2M3 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SrrdQ8K2M3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SrrdQ8K2M3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SrrdQ8K2M3 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrrdQ8K2M3 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrrdQ8K2M3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrrdQ8K2M3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrrdQ8K2M3 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrrdQ8K2M3 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrrdQ8K2M3 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrrdQ8K2M3 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrrdQ8K2M3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrrdQ8K2M3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrrdQ8K2M3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrrdQ8K2M3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrrdQ8K2M3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrrdQ8K2M3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrrdQ8K2M3 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrrdQ8K2M3 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrrdQ8K2M3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrrdQ8K2M3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrrdQ8K2M3 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrrdQ8K2M3 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrrdQ8K2M3 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SrrdQ8K2M3 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SrrdQ8K2M3 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrrdQ8K2M3 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrrdQ8K2M3 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrrdQ8K2M3 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrrdQ8K2M3 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrrdQ8K2M3 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SrrdQ8K2M3 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrrdQ8K2M3 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrrdQ8K2M3 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrrdQ8K2M3 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrrdQ8K2M3 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrrdQ8K2M3 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrrdQ8K2M3 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrrdQ8K2M3 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrrdQ8K2M3 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrrdQ8K2M3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrrdQ8K2M3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrrdQ8K2M3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrrdQ8K2M3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrrdQ8K2M3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SrrdQ8K2M3 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrrdQ8K2M3 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrrdQ8K2M3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrrdQ8K2M3 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrrdQ8K2M3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrrdQ8K2M3 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrrdQ8K2M3 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrrdQ8K2M3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrrdQ8K2M3 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrrdQ8K2M3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SrrdQ8K2M3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrrdQ8K2M3 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrrdQ8K2M3 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SrrdQ8K2M3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrrdQ8K2M3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrrdQ8K2M3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrrdQ8K2M3 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrrdQ8K2M3 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrrdQ8K2M3 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SrrdQ8K2M3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrrdQ8K2M3 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrrdQ8K2M3 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrrdQ8K2M3 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrrdQ8K2M3 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SrrdQ8K2M3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrrdQ8K2M3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrrdQ8K2M3 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrrdQ8K2M3 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrrdQ8K2M3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrrdQ8K2M3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrrdQ8K2M3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrrdQ8K2M3 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrrdQ8K2M3 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrrdQ8K2M3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrrdQ8K2M3 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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