Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms