Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI0

Nedd4l, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4lQ8CFI0 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms