Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Snx8Q8CFD4 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Snx8Q8CFD4 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Snx8Q8CFD4 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Snx8Q8CFD4 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Snx8Q8CFD4 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Snx8Q8CFD4 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Snx8Q8CFD4 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Snx8Q8CFD4 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx8Q8CFD4 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx8Q8CFD4 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx8Q8CFD4 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx8Q8CFD4 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx8Q8CFD4 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx8Q8CFD4 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx8Q8CFD4 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx8Q8CFD4 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx8Q8CFD4 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx8Q8CFD4 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx8Q8CFD4 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx8Q8CFD4 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx8Q8CFD4 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx8Q8CFD4 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx8Q8CFD4 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx8Q8CFD4 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx8Q8CFD4 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx8Q8CFD4 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx8Q8CFD4 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx8Q8CFD4 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx8Q8CFD4 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx8Q8CFD4 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx8Q8CFD4 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx8Q8CFD4 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx8Q8CFD4 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx8Q8CFD4 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx8Q8CFD4 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx8Q8CFD4 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx8Q8CFD4 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx8Q8CFD4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx8Q8CFD4 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx8Q8CFD4 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx8Q8CFD4 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx8Q8CFD4 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx8Q8CFD4 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx8Q8CFD4 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Snx8Q8CFD4 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Snx8Q8CFD4 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Snx8Q8CFD4 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Snx8Q8CFD4 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Snx8Q8CFD4 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Snx8Q8CFD4 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Snx8Q8CFD4 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Snx8Q8CFD4 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Snx8Q8CFD4 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Snx8Q8CFD4 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
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