Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms